Tutkimuksen tausta
BIOFANTS on Suomen Akatemian rahoittama nelivuotinen tutkimusprojekti. Projektissa tutkimme luonnon monimuotoisuutta asuinympäristöissä ja selvitämme, miten altistuminen luonnon monimuotoisuudelle vaikuttaa vauvojen immunologiseen kehitykseen.
Lasten immunologinen kehitys on pitkä prosessi, johon vaikuttaa altistuminen erilaisille ympäristötekijöille. Nämä asuinympäristöjen altisteet koostuvat fyysisistä, kemiallisista, sosiaalisista ja biologisista tekijöistä. Joidenkin tekijöiden, esimerkiksi ilmansaasteiden, vaikutus terveyteen tunnetaan jo hyvin. Vauvojen immuunijärjestelmän kehitykseen vaikuttaa myös altistuminen bakteereille, joita saadaan muilta ihmisiltä, ravinnosta ja ympäristöstä. Bakteerien lisäksi vauvat kohtaavat muista lajeista peräisin olevia pieniä jäämiä, kuten hilsettä, siitepölyä ja erilaisia itiöitä. Tämän luonnon monimuotoisuuden vaikutuksia ihmisen immunologiseen kehitykseen ei kuitenkaan tunneta juurikaan.
Tutkimuskysymykset
BIOFANTS-projektin tavoitteena on tuottaa uutta ymmärrystä ihmisten immunologiseen kehitykseen vaikuttavista tekijöistä. Tutkimuksessa selvitämme:
- Millaisilla DNA-pohjaisilla menetelmillä ihmisten altistumista luonnon monimuotoisuudelle kannattaa mitata?
- Miten eliökunnan kaikkia pääjaksoja edustava lajisto on yhteydessä vauvojen immunologiseen kehitykseen?
- Voidaanko havaita avainlajeja, jotka joko tukevat tai häiritsevät terveyttä edistävän immuunijärjestelmän kehittymistä?
Osatutkimukset
Projekti koostuu kahdesta osatutkimuksesta:
- Menetelmävertailu: Ensimmäisessä osatutkimuksessa vertailemme erilaisia DNA-pohjaisia menetelmiä pihan ja sisätilojen lajiston mittaamiseen. Pihoilta lajistoa mittaamme ilman partikkeleista koostuvista näytteistä ja sisätiloista pölystä. Näistä selvitämme lajistoa sekvensoinnin avulla käyttäen sekä metagenomiikan että DNA-viivakoodauksen menetelmiä. Tavoitteena on tutkia mikä tai mitkä menetelmät ovat kustannustehokkaimpia luonnon monimuotoisuuden mittaamiseen läpi eliökunnan.
- Immuunijärjestelmän kehitys: Syntymäkohorttiin perustuvan tutkimuksen tavoitteena on arvioida ainakin sisätiloissa esiintyvien eliöiden yhteyttä vauvojen immuunijärjestelmän kehitykseen. Perustamme BIOFANTTI-syntymäkohortin Uudenmaan alueelle. Mittaamme useita kertoja ensimmäisen elinvuoden aikana vauvojen altistumista luonnon monimuotoisuudelle heidän kotiensa sisätiloissa sekä tutkimme pienistä veripisaroista heidän immuunijärjestelmänsä toimintaa proteomiikan keinoin.
Projektin vaikutus
BIOFANTS-projektissa hyödynnämme uusimpia tutkimusmenetelmiä luonnon monimuotoisuuden mittaamiseen sekä kehitämme niitä edelleen. Tutkimus lisää ymmärrystämme ihmisten asuinympäristöjen lajistosta sekä sen mahdollisesta yhteydestä vauvojen immuunijärjestelmän kehitykseen. Projekti tuo yhteen useita tieteenaloja ja niiden osaajia tuottaen siten uudenlaista monitieteistä ymmärrystä ja yhteistyötä.
Muita tutkimuksia
Lisätietoja
Johtava tutkija Jenni Lehtimäki, Suomen ympäristökeskus (Syke), etunimi.sukunimi@syke.fi, p. +358 503 050 007
Projektin tutkimuskoordinaattori Nina Ahola, Suomen ympäristökeskus (Syke), etunimi.sukunimi@syke.fi, p. +358 503 318 936
